這段經文的重點是講耶穌基督實實在在是從天上來的。從天上來的神的兒子是無罪的，因此世人才能在祂裡頭成為神的義，罪得赦免，得拯救。這裏有三個確實的證明：
1.約3:31“從天上來的是在萬有之上。”西1:15說“愛子是那不能看見之神的像，是首生的，在一切被造的以先。”神的像就是神自己，讓人看得見。沒人能看見神，耶穌基督把看不見的神讓我們看見了。祂是首生的，是在萬有之上。世上一切都是根據一個統一的律造的，這個律就是主耶穌基督創造的、規定的。所以主耶穌可以醫治不能醫治的病，可以赦免人的罪，在大風浪的時候可以叫風浪平靜，因為祂在萬有之上。基督徒不可忘記這點。
2.約3:32“他將所見所聞的見證出來，只是沒有人領受他的見證。”主耶穌在地上告訴世人從來不知道的事情。生活在中國西南最邊緣小鎮上的人從未聽說“上海”，以為還有“下海”。神道成肉身來世間見證的也是人從來沒有聽到過的。主耶穌來是把看不見的神表明出來。此外也講到永生、神的國。沒有人聽到過這些。主耶穌帶來的是天國的福音，不是屬地的，是天上神的國度的福音。讓人的生命進到另一個層次，一個天國的層次。這是多大的福音。耶穌基督來是使人的靈魂得救，使人裡面的靈跟上帝有直接的交通。
3.約3:35“父愛子，已將萬有交在他手裡。”意思就是讓祂的愛子管理承受擁有這一切。萬有靠祂而造、而立，神的目的把萬有交給祂。但是宇宙現在有問題，不和諧，世界被敗壞所管轄，連得救的基督徒也會生一些不能治好的毛病，遭受災難。現在的世界是一個分裂的世界，人與人隔膜，家庭發生問題，民族之間有問題。但是這個世界有一天要改變，因為主耶穌基督要承受萬有，那是一個新天新地、新的秩序。不過在承受之前耶穌先把自己當作祭物、和平祭、和睦祭，釘死十字架上，為整個人類死，也為宇宙萬有而死，使萬有與神和好。將來萬物都要和諧，世界真正有和平。信子的人有永生。
