这段经文的重点是讲耶稣基督实实在在是从天上来的。从天上来的神的儿子是无罪的，因此世人才能在祂里头成为神的义，罪得赦免，得拯救。这里有三个确实的证明：
1.约3:31“从天上来的是在万有之上。”西1:15说“爱子是那不能看见之神的像，是首生的，在一切被造的以先。”神的像就是神自己，让人看得见。没人能看见神，耶稣基督把看不见的神让我们看见了。祂是首生的，是在万有之上。世上一切都是根据一个统一的律造的，这个律就是主耶稣基督创造的、规定的。所以主耶稣可以医治不能医治的病，可以赦免人的罪，在大风浪的时候可以叫风浪平静，因为祂在万有之上。基督徒不可忘记这点。
2.约3:32“他将所见所闻的见证出来，只是没有人领受他的见证。”主耶稣在地上告诉世人从来不知道的事情。生活在中国西南最边缘小镇上的人从未听说“上海”，以为还有“下海”。神道成肉身来世间见证的也是人从来没有听到过的。主耶稣来是把看不见的神表明出来。此外也讲到永生、神的国。没有人听到过这些。主耶稣带来的是天国的福音，不是属地的，是天上神的国度的福音。让人的生命进到另一个层次，一个天国的层次。这是多大的福音。耶稣基督来是使人的灵魂得救，使人里面的灵跟上帝有直接的交通。
3.约3:35“父爱子，已将万有交在他手里。”意思就是让祂的爱子管理承受拥有这一切。万有靠祂而造、而立，神的目的把万有交给祂。但是宇宙现在有问题，不和谐，世界被败坏所管辖，连得救的基督徒也会生一些不能治好的毛病，遭受灾难。现在的世界是一个分裂的世界，人与人隔膜，家庭发生问题，民族之间有问题。但是这个世界有一天要改变，因为主耶稣基督要承受万有，那是一个新天新地、新的秩序。不过在承受之前耶稣先把自己当作祭物、和平祭、和睦祭，钉死十字架上，为整个人类死，也为宇宙万有而死，使万有与神和好。将来万物都要和谐，世界真正有和平。信子的人有永生。
